超市不卖烟的原因主要 是因为它们需要办理烟草特行证和定点经营。烟草是专卖商品，销售烟草需要特定的许可证，即烟草经营许可证。此外，根据《烟草专卖许可证管理办法》的规定，外商投资商业企业或个体工商户不得从事烟草专卖品批发或零售业务。因此，如果超市没有获得烟草许可证，它们是不被允许销售烟草的。
尽管有些超市可能设有烟草销售区，但这通常是因为它们是烟草公司的联营店或合作伙伴，而不是因为超市本身拥有销售烟草的许可。此外，烟草销售通常需要专门的柜台和人员，并且要遵守烟草销售的相关规定，如不得串货等。
综上所述，超市不卖烟主要是因为缺乏必要的烟草经营许可证和相关的销售许可。