工程质保金的结算方式主要依据合同约定，以下是一些常见的结算方式：
工程质保金通常按照项目工程价款结算总额乘以合同约定的比例（一般为5%）来计算。例如，如果一个项目的工程价款总额为1000万元，那么质保金就是50万元。
在工程竣工后，一次性计算并扣除全部质保金。这种方式下，质保金在工程最后一次付款时一并结算，扣除后付清其他款项。
根据合同约定，每次付款时都按比例扣除相应的质保金。这意味着在项目的各个付款阶段，都会根据当时的工程进度和应付款金额计算并扣除质保金。
在工程开始或结束时，除了正常的工程款项外，单独收取一定比例的质保金。这种方式下，质保金在项目初期或结束时一次性支付，而不是在工程进行中逐次扣除。
质保金返还
质保金在缺陷责任期满后，如果没有出现质量问题，承包单位可以向建设单位（业主）申请返还工程质保金。具体流程如下：
承包单位在缺陷责任期满后14天内提出返还申请。
建设单位（业主）在接到申请后14天内进行审查，如无异议，应在14天内返还质保金。
如果逾期支付，建设单位（业主）需要从逾期之日起按照同期银行贷款利率计付利息，并承担违约责任。
注意事项
质保金的计算和支付应严格按照合同条款执行，确保双方权益。
质保金的金额和比例应在合同中明确约定，避免后期纠纷。
质保金的返还流程和时限也应明确，以确保承包单位的合法权益得到保障。
综上所述，工程质保金的结算方式多样，具体采用哪种方式应根据项目实际情况和合同约定来确定。