公司清算需要向两个主要部门进行备案：
清算组成立后，应在10日内将清算组成员和清算组负责人名单向工商部门备案。备案时需要提交《公司登记（备案）申请书》、股东大会决议、清算组成员身份证复印件等材料。
进入清算期的企业应对清算事项及其附报资料，报主管税务机关备案。纳税人有解散、撤销、破产情形的，在清算前应当向其主管税务机关报告；未结清税款的，由其主管税务机关参加清算。
建议
提前规划：公司在决定清算时，应提前规划好清算流程，确保按时完成工商和税务部门的备案工作。
材料准备：准备好所有必要的备案材料，确保材料的真实性和完整性，避免因材料不全或错误导致备案失败。
沟通协作：与工商和税务部门保持良好的沟通，确保在备案过程中能够及时解决遇到的问题。
通过以上步骤，公司可以顺利完成清算备案，为后续的清算工作奠定坚实基础。