工程完工结算应当按照以下步骤进行：
承包人应在合同约定时间内编制完成竣工结算书，并在提交竣工验收报告的同时递交给发包人。
承包人向发包人递交的竣工结算报告应包括完整的结算资料，以便发包人进行核实和确认。
发包人在收到承包人递交的竣工结算报告及结算资料后，应在合同约定的时间内进行核实，并给予确认或者提出修改意见。
发包人根据确认的竣工结算报告向承包人支付工程竣工结算价款，通常保留3%左右的质量保证（保修）金，待工程交付使用一年质保期到期后清算。
质保期内如有返修，发生费用应在质量保证金内扣除。
除了上述方式，工程竣工结算还可以采用分段结算、竣工后一次结算、按月结算等方式，具体方式应根据合同约定和工程实际情况确定。
如果发包人和承包人对工程竣工结算价款发生争议，应按照合同约定的争议处理方式进行处理。
通过以上步骤，可以确保工程完工结算的顺利进行，并保障双方的合法权益。建议在实际工作中，各方应严格按照合同约定和相关法规进行操作，以确保结算过程的公正和高效。