公司起诉公司的流程主要包括以下几个步骤：
向有管辖权的法院立案庭递交诉状，明确表达诉求和事实依据。
法院会对起诉进行审查，符合立案条件的，会通知当事人在规定时间内交纳诉讼费，并正式立案。
如果不符合立案条件，法院会裁定不予受理。
法院会提前通知当事人开庭的时间、地点以及承办人。公开审理的案件还会提前进行公告。
在开庭时，法院会宣布开庭，核对当事人身份，宣布合议庭成员，告知当事人权利义务，并询问是否申请回避。然后进行法庭调查、举证质证、法庭辩论和法庭调解等程序。
如果达成调解协议，法院会制作调解书，双方当事人签收后生效，当事人履行调解书内容或申请执行。
如果未达成调解协议，合议庭会合议后作出裁决（宣判）。
建议：
在起诉前，建议公司准备好所有相关的起诉材料和证据，并咨询专业律师以确保起诉材料的完整性和合法性。
公司在递交诉状时，应确保起诉状内容完整、准确，符合法律要求。
在整个诉讼过程中，公司应积极配合法院的工作，按照法院的要求提交相关材料和参加庭审。