日本的加班费计算方式主要根据每天和每周的法定劳动时间进行规定。具体计算方式如下：
超出每天法定劳动时间（8小时）的部分，工资按照1.25倍计算。
超出每周法定劳动时间（40小时）的部分，工资按照1.25倍计算。
超出法定劳动时间的部分，工资按照1.25倍计算。
超出60小时的部分，工资按照1.5倍计算。
工资为1.35倍。
通常指从晚上22点到次日早上5点的工作，工资为1.25倍。但如果在工作日加班并且已经加班到晚上十点以后，这部分的工资则为1.75倍。
这些规定适用于日本所有行业和企业，但具体的加班费计算可能会因公司政策、行业惯例或劳动合同的不同而有所调整。建议在实际工作中参考所在公司的具体规定和劳动合同中的条款。