40年产权公寓的过户费用计算如下：
买方需缴纳契税，税率为房屋总价的3%。
买卖双方各需缴纳印花税，税率为房屋总价的0.05%。
增值税的征收标准为房屋总价的差额的5.6%。
卖方需缴纳个人所得税，税率为房屋转让收入减去原值和合理费用后的差额的20%。
土地增值税的计算较为复杂，根据增值额的不同，税率分为四档，分别为增值额的30%、40%、50%和60%。
非普通二手房类为550元/套。
总结：
40年产权公寓的过户费用包括契税、印花税、增值税、个人所得税和土地增值税。具体费用根据房屋的总价、增值额以及是否满足特定条件（如普通住宅、唯一住房等）而有所不同。建议在实际操作中，咨询专业的房地产机构或律师以获取最准确的税费计算。