在辞职时保护自己的合法权益，您可以遵循以下步骤和注意事项：
根据《劳动合同法》第三十七条，劳动者应提前三十日以书面形式通知用人单位解除劳动合同。
试用期内，提前三天通知。
提交书面辞职信，并通过邮件、微信等方式发送，保留好发送记录和回执作为证据。
仔细阅读劳动合同中关于辞职的条款，了解是否有补偿或其他权益。
完成所有工作交接，并确保交接清楚，避免后续纠纷。
如果公司违法辞退或合同到期不续签，根据劳动法规定，您可能有权获得经济补偿金或赔偿金。
保留好所有与辞职相关的文件，如离职申请单、劳动合同到期不续签确认书、离职交接表、解除劳动合同协议书、工资结算确认单等。
如果公司拒绝支付经济补偿或存在其他违法行为，您可以向当地劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
如果仲裁结果不满意，您还可以在法定期限内向人民法院提起诉讼。
注意劳动争议申请仲裁的时效通常为一年，从当事人知道或应当知道其权利被侵害之日起计算。
不要接受公司未经协商发出的自动离职通知，这可能导致您失去应有的权益。
请确保在辞职过程中，每一步都依法而行，并妥善保留所有相关证据，以备不时之需。