处理车辆违规扣分的方法如下：
携带身份证、驾驶证和行驶证到违章处理大厅办理。
如果是现场贴罚单的，可以当场缴纳罚款。
通过交管局的网上平台处理，适用于扣分在3分以下的违法行为。
可以通过理论知识考试免除扣分处罚。
扣分在3分以上的违法行为需要到违法处理窗口打印处罚决定书，然后到银行缴纳罚款。
持处罚决定书到指定的银行交罚款。
罚款缴纳后，保留好票据。
如果违章发生在异地且扣分达到12分，可能需要车主前往违章地处理，这可能会带来不便。
逾期缴纳罚款的，每日按罚款数额的百分之三加处罚款。
处理违章扣分应遵循《道路交通安全违法行为记分管理办法》和《道路交通安全处理程序规定》等相关法律法规。
建议：
尽量在车辆年审前处理违章扣分，以免影响年审。
如果对违章有异议，可以先查询违章记录，确保处理无误。
可以选择网上处理或现场处理，根据自身情况选择最便利的方式。